HMM密码
隐马尔可夫模型后验状态概率
语法
PSTATES=hmmdecode（seq，TRANS，emi）
[PSTATES，logpseq]=hmmdecode（…）
[PSTATES，logpseq，FORWARD，BACKWARD，S]=hmmdecode（…）
hmmdecode（…，'Symbols'，符号）
说明
PSTATES=hmmdecode（seq，TRANS，emi）计算后验状态概率，PSTATES公司，序列的序号，从隐马尔可夫模型。后验状态概率是处于状态的条件概率K步进我，给定观察到的符号序列，符号. 你用转移概率矩阵来指定模型，反式，以及排放概率矩阵，电磁干扰.反式（i，j）是从状态转换的概率我陈述J.电磁干扰（k，seq）是符号序号从状态发出K.
PSTATES公司数组的长度与序号模型中每个状态对应一行。那个(我,J)的th元素PSTATES公司给出模型处于状态的概率我在J第四步，给定顺序序号.
注意
函数HMM密码在第一次发射之前，从步骤0处处于状态1的模型开始。HMM密码计算中的概率PSTATES公司基于模型从状态1开始的事实。
[PSTATES，logpseq]=hmmdecode（…）退货logpseq公司，序列概率的对数序号，给定转移矩阵反式和发射矩阵电磁干扰.
[PSTATES，logpseq，FORWARD，BACKWARD，S]=hmmdecode（…）返回按比例缩放的序列的前向概率和后向概率S.
hmmdecode（…，'Symbols'，符号）指定发射的符号。符号可以是数字数组、字符串数组或符号名称的单元格数组。默认符号是整数1.通过N，在哪里N是可能排放的数量。
示例
反式=[0.95,0.05；0.10,0.90]; emis=[1/6 1/6 1/6 1/6 1/6 1/6 1/6；1/10 1/10 1/10 1/10 1/10 1/2]; [seq，states]=hmmgenerate（100，trans，emis）；pStates=hmmdecode（seq，trans，emis）[序号，状态]=hmmgenerate（100，trans，emis，…'符号'，{'1'，'2'，'3'，'4'，'5'，'6'}）pStates=hmmdecode（seq，trans，emis，…'符号“，{1”，“2”，“3”，“4”，“5”，“6}）；
工具书类
[1] 杜宾，R.，S。艾迪，A。克罗和G。米奇森。生物序列分析. 英国剑桥：剑桥大学出版社，1998。
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