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T-SNE输出功能

T-SNE输出功能描述

一种tsne输出功能is a function that runs after every数字T-SNE算法的优化迭代。输出功能可以创建图或将数据记录到文件或工作区变量。该函数不能改变算法的进度，但可以停止迭代。

Set output functions using the选项名称值对参数tsne功能。Set选项使用使用Statsetor结构。设置'outputfcn'领域选项函数手柄或函数手柄的单元格数组的结构。

例如，设置一个名称的输出函数OUTFUN.M，，，，use the following commands.

opts = statset（'outputfcn'，，，，@outfun); Y = tsne(X,'选项'，选择）;

使用以下语法编写输出函数。

功能stop = offun（optimvalues，state）stop = false;％不要默认停止switch状态案子'init'％设置图或打开文件案子'iTer'％绘制图或更新变量案子'完毕'％清理图或文件结尾

tsne通过状态andOptimValues变量到您的功能。状态接收值'init'，，，，'iTer'， 或者'完毕'如代码段所示。

tsneOptimValues结构

OptimValues场地 描述
'迭代' 迭代编号
'fval' Kullback-Leibler divergence, modified by exaggeration during the first 99 iterations
'grad' Kullback-Leibler Divergence的梯度，在前99个迭代中通过夸张修改
'夸张' 当前迭代中使用的夸张参数的值
'y' 当前嵌入

T-SNE自定义输出功能

Open Script

此示例显示了如何在tsne。

Custom Output Function

以下代码是执行这些任务的输出函数：

  • 在工作区变量中保留kullback-leibler差异的历史及其梯度的规范。

  • 随着迭代的进行，绘制解决方案和历史记录。

  • 显示停止图上的按钮可以尽早停止迭代而不会丢失任何信息。

输出函数具有额外的输入变量，物种，这使其图能够显示数据的正确分类。有关包含额外参数的信息，例如物种在功能中，请参阅参数化功能。

功能stop = kllogging（最佳价值，状态，物种）执着的H Kllog Iters停止switch状态案子'init'stopnow = false;kllog = [];iters = [];h =图；c = uicontrol（'风格'，，，，“ pusphtton'，，，，'细绳'，，，，'停止'，，，，'Position'，，，，...[10 10 50 20]，'打回来'，@阻止我）;案子'iTer'kllog = [kllog;optimvalues.fval，log（norm（optimvalues.grad））];分配（的基本'，，，，'历史'，kllog）iters = [iters;OptimValues.Iteration];如果长度（iTers）> 1图（H）子图（2,1,2）图（Iters，kllog）;Xlabel（'Iterations') ylabel(“损失和梯度”） 传奇（“分歧”，，，，“日志（norm（渐变））”） 标题（“分歧和日志（norm（渐变））”）子图（2,1,1）gScatter（optimvalues.y（：，1），optimvalues.y（：：，2），物种）标题（“嵌入”）绘制结尾案子'完毕'％ 这里没有什么结尾stop = stopnow;功能stopme（〜，〜）stopnow = true;结尾结尾

使用自定义输出功能

使用Fisher Iris数据（4-D数据集）绘制使用的二维tsne。迭代100处的差异值下降，因为差异是通过早期迭代的夸张值缩放的。在过去的几百个迭代中，嵌入在很大程度上保持不变，因此您可以通过单击来节省时间停止迭代过程中的按钮。

加载渔业rng默认％可再现性opts = statset（'outputfcn'，@（OptimValues，State）Kllogging（OptimValues，state，stelt））;y = tsne（MEAS，'选项'，选择，'算法'，，，，'exact'）；

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