GQSPSIM是一个基于GUI的MATLAB®在QSP模型开发和分析中执行关键步骤的应用程序,包括:
1)使用全局和本地优化方法模型校准
2)虚拟科目的发展探讨代表生物学中的变异性和不确定性
3)针对不同干预措施的虚拟群体模拟。
GQSPSIM适用于素质学®- 建造模型,利用物种,剂量,变体和规则等组件。所有功能都配备了交互式可视化界面和生成呈现准备数字的能力。此外,可以共享标准化的GQSPIM会话以供将来的扩展和重用共享或保存。
源代码和案例研究包含在引用的GitHub帐户中。GQSPAIM和案例研究的描述在出版物中标题为“GQSPSIM:基于SimBiology的GUI应用程序®用于标准化QSP模型开发
和应用“。
指示:
1)在您的计算机上安装MATLAB 2018A。以前版本的MATLAB不兼容,我们尚未在2018B或更高版本中测试该应用程序。
2)安装GUI布局工具箱(//www.tatmou.com/matlabcentral/fileexchange/47982-gui-layout-toolbox.)
3)查看Mac和PC用户支持的编译器列表的以下链接(金宝app//www.tatmou.com/content/dam/mathworks/mathworks-dot-com/金宝appsupport/sysreq/files/systemrequirements-release2018a_supportedcompilers.pdf.)
•3A)对于Mac用户,请安装Xcode。
•3B)对于PC用户,安装支持的编译器(LCC-Win64或Mingw 5.3金宝app C / C ++或Microsoft Visual C ++)
4)安装编译器后,打开MATLAB并运行以下命令
•mex -setup c
•mex -setup c ++
5)检查计算机上已成功配置编译器,请运行以下命令:
•modelobj = sbmlimport('lotka');
•EM = EXPORT(MODEMOBJ)
•加速(EM);
•em.isAccelerated
答案应该是1
在Windows上启用长文件名
1)启动注册表编辑器(Regedit.exe)
2)导航到HKEY_LOCAL_MACHINE\SYSTEM\CurrentControlSet\Control\FileSystem
3)双击LongPathsEnabled
4)设置为1并单击“确定”
5)重新启动
Lemendring案例研究Windows上的ZIP文件
1)下载并安装7-ziphttps://www.7-zip.org/
2)使用7-zip来解压缩案例研究zip文件
GQSPSIM安装:
1)解压缩GQSPSIM.zip在主目录中
2)打开matlab
3)转到主目录/ GQSPSIM / APP
4)运行qspapp
伊拉特·霍斯赛尼尼(2021年)。GQSPSIMGitHub (https://github.com/feigelman/gQSPsim-release)。检索。
灵感来自:GUI布局工具箱那XLWRITE:在Mac / Linux / Win上生成XLS(X)文件,无需Excel那Raacampbell / Shadederrorbar.那小提琴图绘制多个分布(AdditionPlot.m)