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gQSPSim

version 1.1 (40.2 MB) by Iraj Hosseini
该应用程序是为标准化的QSP模型开发而开发的

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更新2021年3月05

从GitHub

在GitHub上查看许可证

gQSPSim是一个基于gui的MATLAB®应用程序,执行QSP模型开发和分析的关键步骤,包括:

1)采用全局和局部优化方法进行模型标定
2)虚拟学科的发展,以探索所代表的生物学中的可变性和不确定性
3)模拟不同干预的虚拟人群。

gQSPSim与SimBiology®构建的模型合作,利用物种、剂量、变异和规则等组件。所有功能都配备了一个交互式可视化界面和生成准备好演示的图形的能力。此外,可以共享或保存标准化的gQSPSim会话,以便将来扩展和重用。

源代码和案例研究包括在github的引用帐户。关于gQSPSim的描述和案例研究发表在《gQSPSim:一个基于SimBiology®的用于标准化QSP模型开发和应用的GUI应用》一书中。

产品说明:

1)在您的计算机上安装Matlab 2018a或更高版本。以前的版本的Matlab是不兼容的。

2)查看下面的链接,以获得Mac和PC用户支持的编译器列表(金宝app//www.tatmou.com/content/dam/mathworks/mathworks-dot-com/金宝appsupport/sysreq/files/SystemRequirements-Release2018a_SupportedCompilers.pdf
•2a)对于Mac用户,安装xcode
•2b) PC用户,安装一个支持的编译器(lcc-win64或MinGW 5.金宝app3 C/ c++或Microsoft Visual c++)

3)编译器安装完成后,打开Matlab,运行以下命令
•mex -setup
•mex -setup c++

4)要检查编译器是否在您的计算机上配置成功,请运行以下命令:
•modelObj = smblimport ('lotka');
•em = export(modelObj)
•加快(em);
•em.isAccelerated

答案应该是1

在Windows上启用长文件名

1)打开注册表编辑器(regeit .exe)
2)导航到HKEY_LOCAL_MACHINE\SYSTEM\CurrentControlSet\Control\FileSystem
3)双击“LongPathsEnabled”
4)设置为“1”,单击“确定”
5)重新启动

在Windows上解压案例研究Zip文件

1)下载并安装7-ziphttps://www.7-zip.org/
2)使用7-zip解压案例研究zip文件

gQSPSim安装:

1)打开Matlab
2)安装gQSPSim.mltbx
3)在APPS工具栏中运行gQSPSim

更新v1.1

*兼容R2018a-2020b
*最新个案研究
*并行队列生成和模拟的改进
*提高了会话的跨平台兼容性
*限制绘制图时显示的可配置轨迹数量
*改进了对任务的规则/反应的选择
*改进了对Window金宝apps长文件名的支持
*捆绑图形库依赖
*各种bug修复

引用作为

Iraj Hosseini(2021)。gQSPSimGitHub (https://github.com/gQSPSim/gQSPsim-release/releases/tag/v1.1)。检索

MATLAB版本兼容性
创建R2018a
兼容R2018a及后续版本
平台的兼容性
窗户 macOS Linux
社区
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