文件交换
与Allen Brain Observatory交互的MATLAB工具箱
用于脑磁图和脑电图分析的MATLAB软件工具箱
头脑风暴：MEG/EEG数据分析的开源应用程序
运行Canlab Matlab工具箱所需的核心工具。这个工具箱的核心是支持交互分析的面向对象工具
从客户端与飞轮API交互以进行搜索、获取、放置和计算。
心理物理学工具箱第3版（PTB-3）是一套用于视觉和神经科学研究的自由Matlab和GNU倍频程函数。
一个用于读写NWB文件的Matlab接口。
超极化MRI采集工具和重建方法
NIfTI转换、可视化和转换工具
处理电生理数据的工具箱
带Matlab ROI工具的3D图像查看器（NIFTI查看器，手动分割）
用于运行神经生理学实验和管理数据的MATLAB工具箱
使用qMRLab可以轻松进行定量磁共振成像：使用GUI或CLI来拟合和模拟大量的qMRI模型。
提供实时语音夹带神经反馈的脑电脑机接口系统
在大规模钙成像数据中，多个阶段的细胞配准
用于读写CIFTI连接文件的MATLAB代码
使用基于引导的显著性测试，对任何类型的数据进行单层和多层中介分析。
用于电磁脑成像应用中基于有限元的正向和反向模拟的简单工具。
识别立体图像中的三维结构
DeepSqueak：一个基于深度学习的超声波发声量化系统
使用spm1d软件包(v.0.4.3)，使用非参数方法(排列检验)，计算从anova1到anova3rm的方差分析和临时检验。
单光子和双光子成像数据集钙成像分析软件包。https://github.com/bahanonu/calciumImagingAnalysis
xolotl：一个快速而强大的神经元和网络模拟器
ExploreASL是一个标准化的多中心管道，用于动脉自旋标记灌注MR图像的图像处理和统计。
神经信号与连续刺激相关的MATLAB程序包
建立在关系数据库之上的科学工作流管理框架。
DynaSim简化了建立和仿真动态系统模型的过程。
用于分析脑成像数据序列的免费开源软件
斯隆视力视力表视型
Jaelia自动动物行为注释器
基于matlab的尖峰排序的NEV文件
一种微型1光子钙成像信号提取管道。
多参数图像处理的医学软件
用于颅内电极数据定位和交互可视化的MATLAB和Bash脚本
峰值提取工具
EEG信号处理工具，能够检测癫痫发作、绘制图表、频谱图和计算功率。
从钙信号中提取峰值（Deneux等人，2016年）
MATLAB示例使用深度学习分类年龄从脑MRI图像
计算三维结构的分形维数
因果分解分析发表于《自然通讯》2018；9:3378
单电极细胞外记录模拟器
变分贝叶斯分析（VBA）
这个函数提供了头部在'ch_list'给出的所需点上的地形图及其赋值。
表征瞬时钙信号
这是一个教程，旨在让MATLAB新手快速上手和运行。
基于MATLAB的基于模板的眼动数据分析工具
脑区输入输出
该代码实现了一种基于马氏距离和EDF统计量的小波多元信号去噪方法(IEE-TSP)
MVGC多元格兰杰因果工具箱有助于从时间序列数据进行格兰杰因果推理。
？一个轻量级的神经成像。nii到。png转换器为Matlab用户
该函数可视化原始(分组)数据以及平均值、95%置信区间和1个SD。
通过电导模型量化大脑结构连通性
用于管理Neuropixel SpikeGLX数据集、Kilosort2排序、波形提取和其他工具的实用程序
对记录的电流进行离线串联电阻校正/补偿
Matlab类导入HEKA Patchmaster文件
UJA-SHFD是专为处理Freesurfer共同管道获得的大脑皮层表面而设计的。
与基因表达相关的细胞结构研究多层次人脑组织
不同对比度的三维图像的刚性配准。
该算法允许您以非常简单的方式计算EEG信号的功率谱密度。
基本（演示）双光子显微镜扫描软件
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