主要内容

高吞吐量排序

基因表达,转录因子和下一代测序(NGS)数据的甲基化分析,包括RNA-SEQ和CHIP-SEQ

高吞吐量排序方法产生大量的序列数据,并且需要强大的计算工具进行进一步分析。BioInformatics Toolbox™提供算法支持下一代测序(NGS)数据的公共分析工金宝app作流程,例如过滤和修剪读取,映射读取参考,计数映射到基因组特征的读数,并执行统计分析。

  • 数据导入
    从SAM,BAM,FASTA,FASTQ,GTF和GFF文件导入下一代测序(NGS)数据和功能注释
  • 预处理
    使用单个和配对读取的NGS数据,过滤器和修剪读取,并显示质量统计信息
  • 结盟
    地图读取参考序列
  • 统计分析
    RNA-SEQ和CHIP-SEQ数据的综述和统计分析
  • 可视化
    可视化读取的对齐方式参考序列

特色例子