读取GAG Polyprotein的多序列对准文件，用于几种HIV菌株。

gagaa = multialignread（'aagag.aln'）

查看对齐的序列序列对齐应用程序。

SEQALIGNVIEWER（GAGAA）;

要更好地可视化序列对齐，可以通过选择来放大展示>放大。多次选择此选项，直到达到所需的缩放级别。

确定您可以改善对齐的区域。

单击字母或区域。所选区域是中心块。然后，您可以将序列拖到中心块的左侧或右侧。

要在此示例中移动单个字母（T），请单击并拖动右侧的字母T（中心块）以插入间隙。

通过向左拖动来关闭差距。

您还可以移动多个残差（后续）。假设您想向可用间隙移动后续差距。首先选择要填写的间隙区域。

将随后从间隙区域的右侧或左侧拖动到间隙区域。

假设您要删除一个或多个对齐的序列。首先选择要删除的序列。然后选择编辑>删除序列。

通过选择删除空列编辑>删除空列。

编辑后，您可以将对齐的序列或共识序列导出到FASTA文件或MATLAB工作区文件菜单。