主要内容
OptimAlleafOrder.
分层群集的最佳叶排序
描述
例子
绘制具有最佳叶订单的树状图
使用分层二进制群集树使用连锁。然后，将树形图绘制与具有最佳叶排序的树木图进行比较。
生成示例数据。
RNG（'默认'）重复性的％x =兰特（10,2）;
创建距离矢量和分层二进制群集树。使用距离和聚类树来确定最佳叶序。
d = pdist（x）;树=联动（D，'平均'）;LEAFORDER = OPTEMALLEAFORDER（树，D）;
用最佳叶子排序绘制Dendrogram和DendOrgram。
图（）子图（2,1,1）树木（树）标题（'默认叶订单'）子图（2,1,2）树枝状图（树，'重新排序'，叶滴当）标题（'最佳叶订单'）
底部图中叶子的顺序对应于元素叶芽。
叶芽
LEGORDER =.1×101 4 9 10 2 5 8 3 7 6
使用逆距离相似性的最佳叶序命令
生成示例数据。
RNG（'默认'）重复性的％x =兰特（10,2）;
创建距离矢量和分层二进制群集树。
d = pdist（x）;树=联动（D，'平均'）;
使用逆距离相似度变换来确定最佳叶序。
Leaforder = Optimalaleaford（树，D，'转型'那'逆'）
LEGORDER =.1×101 4 9 10 2 5 8 3 7 6
输入参数
输出参数
参考
[1] Bar-Joseph，Z.，Gifford，D.K.和Jaakkola，T.S.（2001）。“用于分层聚类的快速最佳叶排序。”生物信息学卷。17，4：S22-9。PMID：11472989。
在R2012B中介绍
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