主要内容

网络分析和可视化

将基本图理论算法应用于蛋白质 - 蛋白质相互作用(PPI)和其他基因网络;使用交互式地图,层次结构图和路径查看网络关系

使用各种图形算法分析基因网络和蛋白质 - 蛋白质相互作用。代表使用稀疏矩阵的不同类型的图形。使用该图形化图形和网络关系传记允许您计算节点位置,绘制图形的对象,并在节点之间找到关系。

职能

graphallshortestpath. 找到图形中的所有最短路径
graphconncomp. 在图中找到强烈或弱连接的组件
graphisdag. 测试指示图中的循环
格子异常 在两个图之间查找同义
graphanspantree. 确定树是生成树
graphmaxflow. 计算定向图中的最大流量
graphminspantree. 在图中查找最小的生成树
graphpred2path. 将前任指数转换为路径
graphshortestPath. 解决图表中最短路径问题
graphtopoorder. 执行拓扑类型的定向无循环图
graphTraverse. 通过遵循相邻节点来横穿图形

班级

传记 创建传记对象
传记对象 数据结构包含用于实施定向图形的通用互连数据

话题

图论函数

图形理论在BioInformatics工具箱™中的函数将基本图形理论算法应用于稀疏矩阵。

图形可视化

BioInformatics工具箱包括用于创建,查看和操纵图形,例如交互式映射,层次结构图和路径的函数,对象和方法。

特色例子