主要内容

AA2NT.

将氨基酸序列转化为核苷酸序列

句法

SEQNT.= aa2nt (seqaa.
SEQNT.= aa2nt (seqaa.……“GeneticCode”,GeneticCodevalue.,......)
SEQNT.= aa2nt (seqaa., ...'字母'AlphabetValue,......)

输入参数

seqaa.

下列其中之一:

例子:'arn'[1 2 3]

GeneticCodevalue.

整数,字符向量或字符串指定表中的遗传代码号或代码名称遗传密码.默认是1'标准'

提示

如果使用代码名称,则可以将名称截断到名称的前两个字母。

AlphabetValue

指定核苷酸字母的字符向量或字符串。的选择是:

  • '脱氧核糖核酸'(默认) - 使用符号一种CG,T.

  • “RNA”-使用符号一种CG,

输出参数

SEQNT. 由字母代码的字符向量指定的核苷酸序列。

描述

SEQNT.= aa2nt (seqaa.转换指定的氨基酸序列seqaa.,归还核苷酸序列SEQNT.使用标准的遗传密码。

通常,从氨基酸到核苷酸密码子的映射不是一对一的映射。对于具有多种可能核苷酸密码子的氨基酸,该功能随机选择对应于该特定氨基酸的密码子。对于模棱两可的人物B.Z.,随机选择一个与该字母对应的氨基酸,然后随机选择一个密码子序列。对于二义字符X,从所有可能性中随机选择密码子序列。

SEQNT.= aa2nt (seqaa.,......propertyname.',适当的价值,......)呼叫AA2NT.具有使用属性名称/属性值对的可选属性。您可以按任何顺序指定一个或多个属性。每个propertyname.必须用单引号括起来,而是不论不敏感。这些属性名称/属性值对如下:

SEQNT.= aa2nt (seqaa.……“GeneticCode”,GeneticCodevalue.,......)指定在将氨基酸序列转换为核苷酸序列时用于使用的遗传密码。GeneticCodevalue.可以是整数、字符向量或指定表中的代码号或代码名的字符串遗传密码.默认是1'标准'.表中显示了标准遗传码的氨基酸对标准遗传密码的核苷酸密码子映射标准遗传密码

提示

如果使用代码名称,则可以将名称截断到名称的前两个字母。

SEQNT.= aa2nt (seqaa., ...'字母'AlphabetValue,......)指定一个核苷酸字母表。AlphabetValue'脱氧核糖核酸',它使用符号一种CG,T., 或者“RNA”,它使用符号一种CG,.默认是'脱氧核糖核酸'

遗传密码

代码 代码名称
1 标准
2 脊椎动物的线粒体
3. 酵母线粒体
4. 模子原虫泛龄线粒体,支原体/螺原体
5. 无脊椎动物的线粒体
6. Ciilian.Dasycladacean,六塔核
9. Echinoderm线粒体
10. Euplotid核
11. 细菌植物塑料
12. 替代酵母核
13. 阿立迪亚教线粒体
14. 扁虫线粒体
15. Blepharisma核心
16. 叶绿素线粒体
21. 吸虫线粒体
22. Scenedesmus斜肌线粒体
23. Thraustochytrium线粒体

标准遗传密码

氨基酸名称 氨基酸代码 核苷酸密码子
丙氨酸 一种 GCT GCC gca GCG
精氨酸 R. CGT CGC CGA CGG AGA AGG
天冬酰胺 N. AAT AAC.
天冬氨酸(天冬氨酸) D. GAT GAC.
半胱氨酸 C TGT TGC.
谷氨酸 问: CAA CAG
谷氨酸(谷氨酸) E. 棉酚的呕吐
甘氨酸 G GGT GGC gga GGG
组氨酸 H 猫CAC
异吲哚 一世 ATC ATA
亮氨酸 L. TTA TTG CTT CTC CTA CTG
赖氨酸 K. aaa aag.
甲硫氨酸 m 阿格
苯丙氨酸 F TTT TTC.
脯氨酸 P. CCT cca CCG
丝氨酸 S. TCT TCC TCA TCG AGT AGC
苏氨素 T. ACT ACC ACA ACG
色氨酸 W. TGG.
酪粉 y TAT,TAC.
缬氨酸 V. gtt gtc gta gtg
天冬酰胺或天冬氨酸(天冬氨酸) B. 随机密码子D.N.
谷氨酰胺或谷氨酸(谷氨酸) Z. 随机密码子E.问:
未知的氨基酸(任何氨基酸) X 随机密码子
翻译停止 * TAA标签TGA.
长度不定的间隙 - ---
未知的字符(表中的任何字符或符号) 还是 ???

例子

全部收缩

创造氨基酸序列。

SEQ = RANDSEQ(20,'字母''amino'
seq = ' TYNYMRQLVVDVVITNHYSV '

使用标准遗传密码将其转换为核苷酸序列。

AA2NT(SEQ)
ans ='AcatataActacatgagaccttgtagttgacgttgtcattactaAccactaGCGTT'

用脊椎动物线粒体遗传密码转化它。

AA2NT(SEQ,“GeneticCode”, 2)
ans ='acctataactacatacgccaactcgtagtggatgtagtaattactaatcactattcggtt'

使用echInoderm线粒体遗传码和RNA字母转换。

AA2NT(SEQ,“GeneticCode”“电子商务”'字母'“RNA”
ans = ' ACGUAUAACUACAUGCGGCAGUUAGUUGUCGACGUCGUGAUUACGAACCAUUAUAGUGUC '
之前介绍过的R2006a