mslowess
用非参数法平滑峰值信号
语法
你= mslowess (X，强度）
mslowess(…“秩序”,OrderValue,……)
mslowess(…“跨越”,SpanValue,……)
mslowess(…“内核”,KernelValue,……)
mslowess(…，'RobustIterations',RobustIterationsValue,……)
mslowess(…，'ShowPlot',ShowPlotValue,……)
参数
X |
一组具有峰值的信号的分离单位值的向量。向量中的元素数等于矩阵中的行数强度．分离单元可以量化波长、频率、距离、时间或m/z，这取决于产生信号数据的仪器。 |
强度 |
具有相同分离单位范围的一组峰值的强度值矩阵。每一行对应一个分离单元值，每一列对应一组有峰值的信号或保留时间。行数等于向量中的元素数X． |
描述
提示
使用以下语法处理来自产生信号数据的任何分离技术的数据，如光谱学、核磁共振、电泳、色谱或质谱。
你= mslowess (X，强度）强度，使用默认跨度为的局部加权线性回归(Lowess)方法10样本。
请注意
mslowess假设输入向量，X，可能没有均匀间距的分离单元。因此，用于平滑的滑动窗口的居中使用最接近的样本X价值而非以之而论X索引。
请注意
当输入向量，X，没有重复值或NaN值，算法的速度大约是原来的两倍。
mslowess (调用X，强度,……”PropertyName'，PropertyValue,……)mslowess使用属性名/属性值对的可选属性。可以以任意顺序指定一个或多个属性。每一个PropertyName必须用单引号括起来，不区分大小写。这些属性名/属性值对如下:
mslowess(…“秩序”,指定顺序(OrderValue,……)OrderValue1(线性多项式拟合或Lowess)，2(二次多项式拟合或黄土)，或0(相当于加权局部均值估计器，而且可能更快，因为只执行平均值计算，而不是最小二乘回归)。默认值为1．
请注意
曲线拟合工具箱™软件也指低阶平滑2黄土平滑。
mslowess(…“跨越”,指定平滑内核的窗口大小。如果SpanValue,……)SpanValue1，窗口等于SpanValue独立于分离单位向量的样本数，X．默认值为10样本。较高的值将使信号更加平滑，但要牺牲计算时间。如果SpanValue小于1，窗口大小被认为是数据中点数的一个分数。例如,当SpanValue是0.005，窗口大小等于0.50中点数的%X．
mslowess(…“内核”,所指定的函数KernelValue,……)KernelValue用于对观测到的强度进行加权。靠近被平滑的分离单元位置的样本在确定估计值时具有最大的权重。KernelValue可以是以下字符向量(或字符串)中的任何一个:
“tricubic”(默认)(1 - (dist /距离)。^ 3)。^ 3“高斯”- - - - - -exp (- (2 * dist /距离)^ 2)。“线性”- - - - - -1-dist /距离
mslowess(…，'RobustIterations',指定迭代次数(RobustIterationsValue,……)RobustValueRobustIterationsValue是0(默认)，不执行健壮拟合。对于鲁棒平滑，在每个跨度上的小残差值被忽略，以改进新的估计。1或2健壮的迭代通常就足够了，而较大的值在计算上可能会比较昂贵。
请注意
对于一个X具有均匀间距分离单元的向量，具有非鲁棒平滑OrderValue等于0相当于用核向量对信号进行滤波。
mslowess(…，'ShowPlot',在原始信号上绘制平滑信号。当你打电话ShowPlotValue,……)mslowess没有输出参数，信号被绘制，除非ShowPlotValue是假．当ShowPlotValue是真正的，只有第一个信号强度是绘制。ShowPlotValue也可以包含到?中的一个信号的索引强度．
例子
加载一个mat文件，包括生物信息学工具箱™软件，其中包含一些示例数据。
负载sample_lo_res平滑频谱，画出原始信号和平滑信号的第一个频谱图。
y = mslowess (MZ_lo_res Y_lo_res,“Showplot”,真正的);
放大图中的一个区域，看看原始信号和平滑信号的区别。
轴([7350 7550 0.1 1.0])
另请参阅
mspalign|msbackadj|msdotplot|msalign|msheatmap|mslowess|msnorm|mspeaks|msresample|msppresample|mssgolay|msviewer
您也可以从以下列表中选择网站:
