绘制来自LC / MS或GC / MS数据集的峰值列表集
msdotplot(
PeakList.
那时代
的)
msdotplot(Fighandle.
那PeakList.
那时代
的)
msdotplot(...,'smartile',stantilevalue.
的)浮子
= msdotplot(...)
PeakList. |
峰值列表的单元阵列,其中每个元素是具有第二列中的第一列中的M / Z值的双列矩阵和第二列中的离子强度值。每个元素对应于频谱或保留时间。 提示 你可以使用 |
时代 |
与LC / MS或GC / MS数据集相关联的保留次数。元素的数量时代 等于单元格数组中的元素数PeakList. 。提示 你可以使用 |
Fighandle. |
处理一个开放的人物窗口,例如由此创建的窗口msheatmap. 功能。 |
stantilevalue. |
指定百分比的值。当峰值被强度排列时,只绘制高于该百分比的那些。选择是任何价值≥0 和≤1. 。默认为0. 。例如,设置stantilevalue. =0. 绘制所有峰,设置stantilevalue. =0.8 绘图只有20%最强烈的峰值。 |
浮子 |
处理线系列对象(图绘图)。 |
msdotplot(
从液相色谱/质谱(LC / MS)或气相色谱/质谱(GC / MS)数据集中绘制一组峰列表。PeakList.
那时代
的)PeakList.
,一个峰值列表的单元阵列,其中每个元素是具有第二列中第一列和离子强度值中的m / z值的双列矩阵,并且时代
,与光谱相关的保留时间的载体。PeakList.
和时代
具有相同数量的元素。数据被绘制到由此产生的任何现有图中msheatmap.
功能;否则,数据将绘制到新的数字窗口中。
msdotplot(
将一组峰值列表绘制到带有手柄中的开放式窗口中包含的轴上Fighandle.
那PeakList.
那时代
的)Fighandle.
。
提示
该语法可用于覆盖在由此创建的质谱数据的热图之上覆盖点绘图msheatmap.
功能。
msdotplot(...,'smartile',
绘制最强烈的峰值,特别是那些在指定的百分比中的峰值stantilevalue.
的)stantilevalue.
。选择是任何价值≥0
和≤1.
。默认为0.
。例如,设置stantilevalue.
=0.
绘制所有峰,设置stantilevalue.
=0.8
绘图只有20%最强烈的峰值。
将句柄返回到行系列对象(图绘图)。您可以将此句柄用作输入浮子
= msdotplot(...)得到
函数显示绘图的属性列表。您可以将此句柄用作输入放
函数来更改绘图的属性,包括显示和隐藏点。
加载包含在BioInformatics Toolbox™软件中的MAT文件,其中包含LC / MS数据变量,包括山顶
和ret_time.
。山顶
是峰列表的小区阵列,其中每个元素是M / Z值和离子强度值的两列矩阵,并且每个元素对应于频谱或保留时间。ret_time.
是与LC / MS数据集相关联的保留时间的列向量。
加载lcmsdata.
仅使用5%最强烈的峰值创建点绘图。
msdotplot(ms_peaks,ret_time,'standile',0.95)
重新采样数据,然后创建LC / MS数据的热图。
[MZ,Y] = MSPPRESAMPLE(MS_PEAKS,5000);MSHEATMAP(MZ,RET_TIME,LOG(Y))
覆盖热图上的点绘图,然后放大以查看详细信息。
msdotplot(ms_peaks,ret_time)轴([480 532 375 485])
mspalign.
|MSBABADJ.
|Msdotplot.
|msalign.
|msheatmap.
|Mslowess.
|msnorm.
|mspeaks.
|msresample.
|msppresample.
|Mssgolay.
|Msviewer.