使用序列查看器应用程序探索蛋白质序列 - Matlab＆Simulink金宝app - 金宝app,下载188bet金宝搏,金宝搏官方网站

使用序列查看器应用探索蛋白质序列

这序列观看者App集成了BoiCinomatics Toolbox™工具箱中的许多序列功能。而不是在Matlab中输入命令^®命令窗口，您可以使用应用程序选择并输入选项。

以下步骤说明了如何观察位于核苷酸序列中的ORF的氨基酸序列。您可以导入自己的氨基酸序列，或者您可以从GenBank获得蛋白质序列^®数据库。该示例使用Genbank登录号NP_000511，其是与Tay-Sachs病相关的人酶的α亚基。

选择文件>从> ncbi下载序列。
这从NCBI下载序列将打开对话框。
在对话框中，键入ncbi数据库条目的登录号，np_000511。点击蛋白质选项按钮，然后单击好的。
这序列观看者访问Web上的NCBI数据库并加载您输入的登录号的氨基酸序列信息。
选择显示>氨基酸配色方案，然后选择收费那功能那疏水性那结构，或者泰勒。例如，选择功能。
显示颜色改变以突出有关氨基酸残基的充电信息。下表显示了氨基酸颜色方案的颜色图例。

氨基酸配色方案	彩色传说
收费	酸性 - 红色基本 - 浅蓝色中性 - 黑色
功能	酸性 - 红色基本 - 浅蓝色氢虫，非极性 - 黑色极性，不带电 - 绿色
疏水性	亲水 - 浅蓝色疏水性 - 黑色
结构	矛盾 - 深绿色外部 - 浅蓝色内部 - 橙色
泰勒	每个氨基酸都基于所提出的颜色分配了自己的颜色W.R. Taylor.。

关上序列观看者使用以下语法从MATLAB命令行：

SEQViewer（'关闭'）

[1]泰勒，W.R.（1997）。残差颜色：Aminochromography的提案。蛋白质工程10,7，743-746。