质谱功能对SELDI-TOF和MALDI-TOF光谱仪的原始数据进行预处理和分类,并使用统计学习功能来识别模式。
阅读原始数据-从逗号分隔值(CSV)文件加载原始质量/电荷和离子强度数据,或读取jcamp - dx格式的质谱数据文件(jcampread
)输入MATLAB®环境。
您也可以有TXT文件中的数据和使用importdata
函数。
预处理的原始数据-将高分辨率数据重新取样至较低分辨率(msresample
),不需要额外的数据点。修正基线(msbackadj
).将光谱与一组参考质量对齐(msalign
),并直观地验证对齐(msheatmap
).将光谱之间的区域归一化以进行比较(msnorm
),并滤除噪音(mslowess
和mssgolay
).
光谱分析-在GUI中加载光谱(msviewer
)用于选择质量峰和进一步分析。
下图说明了工具箱中各种质谱功能的作用。