数据格式和数据库
生物信息学工具箱™ 允许您访问web上的许多数据库和其他在线数据存储库。它允许您将数据复制到MATLAB中®它还可以读取许多常见的基因组文件格式，这样你就不必编写和维护自己的文件阅读器。
基于Web的数据库-您可以直接访问Web上的公共数据库，并将序列和基因表达信息复制到MATLAB环境中。
当前支持的序列数据库是GenBank金宝app®(getgenbank)，GenPept(格特根佩普)，欧洲分子生物学实验室（EMBL）(getembl)，以及蛋白质数据库（PDB）(getpdb)。您也可以使用单个功能访问NCBI基因表达综合（GEO）网站上的数据(getgeodata).
获得多重对齐序列(获取恶意信息)，隐马尔可夫模型剖面图(gethmmprof)，以及系统发育树数据(gethmmtree)来自PFAM数据库。
基因本体数据库-将数据库从Web加载到基因本体对象中(杰奈特).选择本体的各个部分以及geneont对象的方法(GetFounders（geneont）,getdescendants (geneont),getmatrix (geneont),盖特亲属（吉农）)，并使用实用程序函数操作数据(goannotread,结节).
从仪器中读取数据-读取基因测序仪器产生的数据(斯克雷德,joinseq,轨迹图)，质谱仪(jcampread)，安捷伦®芯片扫描仪(阿格费雷德).
读取数据格式-工具箱提供了许多从常见生物信息文件格式读取数据的函数。
序列数据：GenBank(
genbankread)，GenPept(genpeptread)，EMBL(emblread), PDB (pdbread)，和法斯塔(禁区)多重对齐序列:ClustalW和GCG格式(
多重对齐读取)来自微阵列的基因表达数据：基因表达综合（GEO）数据(
地学软件)，GenePix®GPR和GAL文件中的数据(gprread,戈雷德)，SPOT数据(sptread)，Affymetrix®基因芯片®资料(受惊)，和ImaGene®结果文件(成像头)隐马尔可夫模型配置文件：PFAM-HMM文件(
pfamhmmread)
写入数据格式-从Web获取数据的功能包括将数据保存到文件的选项。但是，有一个使用FASTA格式将数据写入文件的功能(法斯塔维特).
爆炸搜索-请求基于Web的BLAST搜索(blastncbi)，从搜索中获取结果(getblast)并从以前保存的BLAST格式的报告文件中读取结果(爆破).
MATLAB环境内置了对其他行业标准文件格式的支持，包括金宝app微软®擅长®和逗号分隔值（CSV）文件。其他函数执行ASCII和低级二进制I/O，允许您开发用于任何数据格式的自定义函数。
相关的话题
您还可以从以下列表中选择网站：
