主要内容

高通量测序

基因表达、转录因子和甲基化分析下一代测序(NGS)数据,包括RNA-Seq和ChIP-Seq

高通量测序方法产生大量的序列数据,并需要强大的计算工具进行进一步分析。Bioinformatics Toolbox™提供算法,支持下一代测序(NGS)数据的常见分析金宝app流程,如过滤和裁剪读取,映射读取到引用,计数映射到基因组特征的读取数,并执行统计分析。

  • 数据导入
    从SAM、BAM、FASTA、FASTQ、GTF和GFF文件中导入下一代测序(NGS)数据和特性注释
  • 预处理
    通过单端和对端读取管理NGS数据,过滤和修剪读取,并显示质量统计信息
  • 对齐
    地图按参考序列读取
  • 统计分析
    读取RNA-seq和ChIP-seq数据的摘要和统计分析
  • 可视化
    可视化读取与参考序列的比对

特色的例子