主要内容
数据导入
从SAM、BAM、FASTA、FASTQ、GTF、GFF文件导入下一代测序(NGS)数据和特征注释
导入不同格式的NGS数据，如FASTA、FASTQ、SAM、BAM文件等。阅读GTF和GFF文件中的特性注释。使用各种对象访问和管理NGS数据。例如,BioIndexedFile对象允许您有效地访问具有大小不一的条目的文本文件，例如序列和注释。当源文件太大而无法放入内存时，使用该对象来访问单个条目或条目的子集。使用BioMap和BioRead对象，用于存储和管理包含头、质量和对齐信息的序列读取数据。
功能
类
主题
使用BioIndexedFile对象来使用索引或键从大文件中提取条目，并使用自定义函数解析数据。
使用BioMap和BioRead对象访问和管理来自各种文件格式(如FASTQ、SAM和BAM文件)的下一代测序(NGS)数据。
使用GTF和GFF特征标注对象从一个或多个参考序列中检索特征信息。
使用各种MATLAB访问在线数据库和存储库®函数并将数据导入工作区以进行进一步的分析。
使用Genomics Viewer应用程序查看细胞色素p450基因单核苷酸变异的NGS比对数据。
特色的例子
你也可以从以下列表中选择一个网站:
