fastainfo

返回关于FASTA文件的信息

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语法

信息= fastainfo(文件)

信息= fastainfo(文件、“超时”)

描述

例子

信息= fastainfo (文件)返回一个结构信息包含关于FASTA的概要信息文件。

例子

信息= fastainfo (文件“超时”,来)设置从远程文件或URL读取数据的连接超时时间(以秒为单位)。

例子

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获取关于FASTA文件的摘要信息

打开生活的脚本

信息= fastainfo (“ex1ref.fasta”)

信息=结构体字段:文件名:“ex1ref。fasta' FilePath: '/mathworks/devel/bat/Bdoc21a/build/matlab/toolbox/bioinfo/bioinfodata' FileModDate: '07-May-2010 16:12:06' FileSize: 1612 NumberOfEntries: 1头:'Reference for ex1'长度:1569

输入参数

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`文件`- - - - - -FASTA文件
特征向量|字符串|字符数组

FASTA文件，指定为下列之一:

指定FASTA文件名、FASTA文件路径和文件名的字符向量或字符串，或指向FASTA文件的URL。如果只指定文件名，则该文件必须在MATLAB上^®搜索路径或当前文件夹。
包含FASTA文件文本的字符数组。

数据类型:字符|字符串

`来`- - - - - -连接超时
5(默认)|积极的标量

从指定为正标量的远程文件读取数据的连接超时。有关详细信息,请参见在这里。

数据类型:双
复数的支持:金宝app是的

输出参数

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`信息`—FASTA文件的概要信息
结构

FASTA文件的概要信息，以结构形式返回。该结构包含以下字段。

场	描述
`文件名`	文件名。
`FilePath`	文件的路径。
`FileModDate`	文件修改日期。
`文件大小`	文件大小(以字节为单位)。
`NumberOfEntries`	文件中的序列条目数。
`头`	如果`文件`如果只包含一个序列，那么这是一个字符向量，包含来自FASTA文件的头信息。否则，此字段为空。
`长度`	如果`文件`如果只包含一个序列，那么这是一个指定序列长度的标量。否则，此字段为空。