主要内容

预处理

使用单个和配对读取的NGS数据,过滤器和修剪读取,并显示质量统计信息

预处理序列使用各种功能读取数据。过滤基于序列的测序数据和修剪终端的质量读取。执行条形码匹配(解复用)以基于条形码进行组样本。将合并的配对端序列数据分成两个单独的文件。计算质量统计数据并使用质量控制图可视化此类信息。

职能

SEQFILTER. 根据指定的标准过滤出序列
SEQTRIM. 根据指定的标准修剪序列
SEQSPLIT. 将序列拆分为基于条形码的单独文件
seqsplitpe. 将合并的配对端序列分成单独的文件
seqqcplot. 为序列和质量数据创建质量控制图

主题

使用基因组件查看器应用程序可视化NGS数据

使用基因组学观察应用来查看细胞色素P450基因的单核苷酸变异的NGS对准数据。