主要内容
遗传变异分析
查找，分析和可视化遗传变异，例如拷贝数变化（CNV）和单核苷酸多态性（SNP）
功能
CGHCBS |
对基于阵列的比较基因组杂交（ACGH）数据进行循环二元分割（CBS） |
CGHFREQPLOT |
显示多个样本中DNA拷贝数更改的频率 |
染色体图 |
绘制带有G带模式的染色体意识形态图 |
GCRMA |
在对GC强大的多阵列平均（GCRMA）背景调整，分位数归一化和中值汇总Affymetrix微阵列探针级数据 |
GCRMABACKADJ |
执行GC强大的多阵列平均（GCRMA）背景调整Affymetrix使用序列信息的微阵列探针级数据 |
最重要的 |
执行两样本t检验以评估两个实验条件或表型的基因的差异表达 |
mafdr |
估计多个假设检验的阳性假发现率 |
mavolcanoplot |
创建显着性与基因表达比（倍数变化）微阵列数据的散点图 |
mairplot |
创建微阵列数据的强度与比率散点图 |
Maboxplot |
为微阵列数据创建框图 |
Maloglog |
创建微阵列数据的Loglog图 |
mapcaplot |
创建微阵列数据的主组件分析（PCA）图 |
nbintest |
未配对的假设检验，用于计数数据的数量较小的计数数据 |
课程
datamatrix |
创建datamatrix对象 |
datamatrix对象 |
数据结构从微阵列实验封装数据和元数据，以便可以通过基因或探针标识符和样品标识符对其进行索引。 |
负细胞测试 |
未配对的假设检验结果 |
特色示例
