SimBiology模型构建器

交互式建立QSP, PK/PD和机械系统生物学模型

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描述

的SimBiology模型构建器app可以让你建立动态系统的模型，如定量系统药理学(QSP)模型，药代动力学/药效学(PK/PD)模型，和系统生物学模型交互。它提供了一个框图编辑器，通过使用内置的块来构建模型反应示意图。

使用该应用程序，你可以:

构建代谢网络、信号通路、QSP模型、PBPK模型、PK/PD模型等多种动态系统。
从内置库创建标准的分区PK模型。
将模型视为图形表示或数学方程。
使用变量来存储与基本模型配置不同的一组参数值或初始条件。
创建一系列剂量，以探索不同的剂量方案。
在MATLAB中导入或导出SimBiology模型^®工作空间或从系统生物学标记语言(SBML)文件。

打开SimBiology模型构建程序

MATLAB工具条:关于应用程序选项卡,在计算生物学，单击应用程序图标。
MATLAB命令提示符:输入simbiology．

例子

编程使用

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`simBiologyModelBuilder`

simBiologyModelBuilder打开应用程序。

`simBiologyModelBuilder (m1）`

simBiologyModelBuilder (m1）打开SimBiology模型m1在SimBiology模型构建器应用程序。

如果SimBiology模型构建器或SimBiology模型分析应用程序已经打开，你不能从命令行加载模型或项目。直接从应用程序加载模型。

`simBiologyModelBuilder (prjFile）`

simBiologyModelBuilder (prjFile）打开项目文件prjFile在SimBiology模型构建器应用程序。prjFile是一个字符串或字符向量，指定SimBiology项目SBPROJ文件的文件名或路径和文件名。如果仅指定文件名，则该文件必须位于MATLAB搜索路径或当前文件夹中。

如果SimBiology模型构建器或SimBiology模型分析应用程序已经打开，你不能从命令行加载模型或项目。直接从应用程序加载模型。