主要内容

建立模型

建立机械系统生物学模型或PK/PD模型

建立QSP、PBPK、PK/PD和系统生物学模型以图形方式使用方框图编辑器用MATLAB编程®功能.使用剂量来模拟各种给药方案,并使用变量来表示生物变异性和假设情景。

应用程序

SimBiology模型生成器 交互构建QSP、PK/PD和机械系统生物学模型
SimBiology模型分析器 分析QSP、PK/PD和机械系统生物学模型

功能

sbiomodel 构造模型对象
斯比奥洛特 回来模拟生物学根对象
sbioreset 删除所有模型对象
sbioselect 搜索具有指定约束的对象
附加隔间 创建隔间对象
附加隔间 将隔室添加到PKModelDesign对象
可观察的 向SimBiology模型添加可观察对象
添加物种 创建物种对象并添加到模型对象内的隔间对象
添加参数 创建参数对象并添加到模型或动力学定律对象
加反应 创建反应对象并添加到模型对象
addrule 创建规则对象并添加到模型对象
添加剂 将事件对象添加到模型对象
建筑 从计算机构建SimBiology模型PKModelDesign对象

物体

全部展开

模型 模型和组件信息
可观察 包含模拟后计算表达式的对象
隔间 包含隔间信息的对象
包含物种信息的对象
参数 参数和范围信息
反应 包含模型反应信息的对象
运动学定律 反应动力学定律信息
规则 物种和参数的保留规则
事件 存储事件信息
持有模型、单位库和抽象动力学定律库
PKModelDesign对象 目的建立药物动力学模型
PK隔室对象 被使用PKModelDesign创造模拟生物学模型
PKModelMap对象 定义SimBiology模型组件的角色

话题

模型制作

受体-配体动力学模型的建立

此示例演示如何使用SimBiology模型生成器SimBiology模型分析器应用程序。

使用SimBiology Model Builder将SGLT2抑制纳入基于生理学的葡萄糖-胰岛素模型

将假设化合物对钠-葡萄糖共转运蛋白2(SGLT2)受体的抑制作用纳入现有的葡萄糖-胰岛素模型。

构造一个简单的模型

此示例演示如何以编程方式构造简单模型。

基因调控途径模型

这个例子展示了如何构建一个简单的基因调控模型并进行模拟。

使用自定义函数创建和模拟模型

此示例演示如何创建自定义函数并将其合并到模型模拟中。

用质量作用动力学定义反应速率

使用质量作用动力学定义零级、一级、二级和可逆反应。

用酶动力学定义反应速率

使用微分方程、质量作用动力学或米氏动力学来定义酶反应。

SimBiology模型中的事件

在SimBiology中,事件是模型中数量或表达式值的离散转换。

创建药代动力学模型

SimBiology允许您创建单室、双室或多室药代动力学模型,用于模型模拟和参数估计。

模型定义

什么是SimBiology模型?

模拟生物学®模型是由一组量和数学表达式描述的动态系统。

物种对象

A.物种对象表示一种物质,即参与反应的化学物质或实体的数量。

SimBiology模型中的剂量

使用剂量模拟不同的给药方案。

SimBiology模型中的变体

使用变量存储模型的备用参数值和初始条件。

SimBiology模型中规则的定义和评估

规则是数学表达式,允许您定义或修改模型数量,即隔间容量、物种数量或参数值。

SimBiology模型中反应的定义和评价

反应是描述改变一个或多个物种的转化、运输或结合过程的数学表达式。