sbiosimulate |
模拟SimBiology模型 |
createSimFunction |
创建SimFunction对象 |
sbiodose |
构建剂量对象 |
adddose |
向模型中添加剂量对象 |
addobservable |
添加可观察对象到SimBiology模型 |
sbiovariant |
构造变量对象 |
addvariant |
向模型添加变体 |
sbiosteadystate |
求稳态SimBiology模型 |
sbioaccelerate |
为加速模拟准备模型对象 |
sbiosampleparameters |
通过抽样协变量模型生成参数(需要统计和机器学习工具箱软件) |
sbiosampleerror |
基于误差模型的采样误差,并在仿真数据中加入噪声 |
sbioplot |
图模拟结果为一图 |
sbiosubplot |
Plot模拟结果在subplot中 |
sbiotrellis |
在格子图中绘制数据或模拟结果 |
sbioensemblerun |
的多个随机集合运行SimBiology模型 |
sbioensembleplot |
使用2-D或3-D图显示集成运行的结果 |
sbioensemblestats |
从集成运行数据获取统计信息 |
可观测的 |
对象,包含用于后模拟计算的表达式 |
场景 |
模拟的场景 |
SimFunction |
执行SimBiology模型的类函数接口 |
ScheduleDose |
确定给药方案 |
RepeatDose |
确定给药方案 |
变体 |
存储备用组件值 |
SimData |
仿真数据 |
Configset |
用于模型仿真的求解器设置信息 |
SolverOptions |
指定模型求解器选项 |
RuntimeOptions |
被砍伐物种的选择 |
CompileOptions |
量纲分析和单位转换选项 |
SimBiology模型构建器 | 交互式建立QSP, PK/PD和机械系统生物学模型 |
SimBiology模型分析 | 分析QSP, PK/PD和机械系统生物学模型 |
使用SimBiology模型分析仪应用程序模拟生物变异与虚拟患者
为模型参数生成样本值,以表示虚拟患者,并进行模拟,以探索模型的可变性。
这个例子展示了如何创建和应用一个变种的G蛋白模型的野生型菌株。
这个例子展示了如何模拟正常和糖尿病受试者的葡萄糖-胰岛素反应。
使用剂量来模拟不同的剂量方案。
使用变量来存储模型的备用参数值和初始条件。
使用各种求解器模拟动态模型。
SimBiology®在模型模拟过程中,使用求解函数计算不同时间间隔的微分方程组的解。金宝搏官方网站
通过将模型转换为编译的C代码来加速仿真或分析。
使用两种不同的方法组合生成的样本。
解决SimBiology模拟错误,如集成公差不满足错误,通过改变求解器或公差。
SimBiology使用AbsoluteTolerance
和RelativeTolerance
在模拟过程中控制积分的精度。
对于模型模拟,SimBiology利用质量平衡原理从模型反应推导出常微分方程(ode)。