来自系列:QSP,PBPK和PK / PD建模和分析的纤维学教程
Sietse Braakman,Mathworks
导入数据和非组件分析视频:此视频演示如何将数据从电子表格导入SimBiology,如何从数据集中的列中计算来自列中的列表数据并可视化数据。数据集还用于执行非组来分析,然后将此分析的结果导出到电子表格。
在此视频中,我们将展示如何将实验数据导入素质生物学以及如何对该数据进行非隔间分析。
我们需要做的第一件事是导入数据,SimBiology允许您直接从文件导入数据,例如逗号分隔或Excel表的电子表格。在这种情况下,我们将使用Theophylline,我们将要将其导入CSV文件。在这种情况下,列分隔符是逗号。并且,一旦您填写它是逗号,您可以看到SimBiology会自动填充列,并填充来自第一行的列标题。
如果我们单击“确定”,则将数据导入素质。您可以重命名数据。在这里,您可以看到数据。在这种情况下,我们有12组。而且,对于每组,我们具有时间表和浓度柱和剂量柱,以及重量柱。因此重量在这里,一个协调性。
在这种情况下,数据由体重标准化。并且,您可以通过向数据集添加列来撤消该归一化。我首先需要填写实际表达式来计算浓度,在名为dv的列中,然后点time wt。并且,点时意味着每个元素的DV值是元素偏置乘以重量。
所以,我们可以给出这个名字。我们可以称之为浓度。并且,我们可以为剂量添加另一栏,因为剂量也标准化。所以,这里我们可以做同样的事情。我们可以说剂量,点次重量,并称为该剂量。
列名下方,您实际上可以看到分类的行。因此,我们可以将这些列中的每一个分类为它们在数据中所代表的内容。浓度是依赖变量。剂量是剂量柱。然后,我们可以将权重设置为协调性。
您还可以为浓度添加单位,例如,每升毫克,毫克的剂量,以及千克的协变量。时间是一个小时。并且,完成我们数据集的整个设置。
我们也可以看看数据本身。在这种情况下,您可以创建一个新的绘图并只需将数据拖动到绘图上。然后,你可以看到这是一个口服给药,其次是清关。我们可以在一个半径y中绘制一个更好的想法。然后,您可以看到这可能看起来像一个隔间模型。
所以,我们现在拥有数据都设置了。如果我们想做非隔间分析,我们唯一需要做的是添加一个名为非区间分析的程序。
此程序采用数据集。在这种情况下,在项目中只有一个数据集,但您的情况可能更多。然后,您需要说要在模型中的分类中使用哪些列。现在,由于您已经在更早的数据中进行了分类,因此自动完成。你唯一需要改变的是,在这种情况下,是给药不是IV推注,而是血管外,所以你需要将剂量柱移动到血管外。
我们可以做的另一件事,我们可以设置时间范围。因此,例如,如果我想计算部分,我在零和12之间使用c。我可以这样做。并且,我还可以定义较低的量化限制。
因此,通过所有这些设置,我可以运行该程序。然后,您可以在此处查看结果。在程序下,最后一次运行。而且,我需要做的唯一是我生成一个新的数据表并将结果拉到这里。在这里,对于12个科目的每个错误,您可以从非区间分析中看到结果。所以,你看到一个AUC,C-MAX,然后一直到最后,你也得到了部分AUC。
如果您愿意,您可以将此导出到工作区,或者您可以做的另一件事,是此数据表编号,您可以将其导出到Excel。
并且,完成此视频正在导入数据进入偶像生物学并执行非隔间分析。
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