SimBiology
模型,模拟和分析生物系统
SimBiology提供应用程序和编程工具进行建模,仿真和分析动态系统,着重于药代动力学/药效学(PK / PD)和系统生物学中的应用。它提供了一个框图编辑器,建筑模型,也可以以编程方式使用MATLAB创建模型®语言。SimBiology包括常见的PK模式,您可以自定义,并与机械系统生物学模型集成库。
各种型号的勘探技术可让您识别细胞通路的最佳给药方案和公认的药物靶标。SimBiology使用常微分方程(常微分方程)和随机解算器来模拟药物暴露,药物效力和酶和代谢物水平的时间过程的轮廓。您可以使用调查参数扫描和敏感度分析系统动力学和指导实验。您还可以使用单一主题或人口数据来估计模型参数。
入门:
建筑模型
构造定量系统药理学(QSP)的,生理上的基于药物代谢动力学(PBPK),或药物动力学/药效学(PK / PD)模型就像你画在一张纸上。
指定型号动态
使用拖和降落块图编辑器或编程工具来构建QSP,PBPK,或PK / PD模型。从系统生物学标记语言(SBML)文件导入现有的模型。
创建模型变量
使用模型的变体来存储一组从基体模型的配置不同的参数值或初始条件的。轻松模拟虚的患者,候选药物,替代方案,并假设假设没有在创建模型的多个副本。
评估给药策略
定义和评估给药策略。评估组合疗法的好处,并通过组合针对不同车型品种给药方案确定最佳的给药策略。
选择一个求解
选择几个可用确定性求解器之一,包括MATLAB ODE求解和日晷求解,或选择的一个随机求解包括随机模拟算法(SSA),显式的tau-跳跃,和隐式的tau-跳跃。
加快模拟
通过转换模式来编译的C代码加速的大的模型或蒙特卡罗模拟仿真。通过分布在多个内核,群集或云计算资源使用模拟进一步提高性能并行计算工具箱™。
非房室分析
计算从药物浓度的时间过程的测量的药物的药代动力学参数,而不假定隔室模型。关于用于单次或多次给药,使用稀疏或连续取样实验和模拟数据进行NCA。
非线性回归
使用估计参数局部或全局的估计方法并计算置信区间参数和模型预测。独立地适合每个组,以产生基团的具体估计或同时适合所有组来估计一组值。
非线性混合效应技术(NLME)
使用NLME方法使用期望最大化的随机逼近(SAEM),一阶条件估计(FOCE),一阶估计(FO)配合人口数据,线性混合效应(LME)的近似,或限制LME近似。
内置任务和互动探索工具
使用内置的分析来分析模型。使用滑块以交互方式探索参数或剂量的模型结果日程变化的影响。
自定义分析
使用SimBiology编程与MATLAB脚本来自动分析并创建自定义的分析。
与SimBiology桌面创建应用程序
使用SimBiology桌面点击创建独立模式的探索应用。
构建自定义应用程序
创建使用MATLAB应用程序构建功能定制的独立应用程序。
观测
执行后仿真计算,例如,以计算区域中的曲线(AUC)下,并使用它作为用于仿真的响应,数据拟合,或全局灵敏度分析
全球灵敏度分析(GSA)
通过计算Sobol指数和通过执行多参数GSA探索在上模型响应模型的数量变化的影响
看到发行说明对任何这些特征和对应的功能的详细说明。