公用事业和序列数据
你可以操作和分析你的序列来获得更深的理解物理,化学和生物特征数据。使用图形用户界面(GUI)的许多序列函数工具箱(seqviewer)。
序列转换和操作——工具箱提供了常用操作例程,如DNA或RNA序列转化为氨基酸序列,使用基本的核酸和蛋白质序列(aa2int,aa2nt,dna2rna,rna2dna,int2aa,int2nt,nt2aa,nt2int,seqcomplement,seqrcomplement,seqreverse)。
你可以通过执行一个操作序列在硅片与限制性内切酶消化限制)和蛋白酶(粘住)。
序列数据——确定各种统计数据序列(aacount,basecount,codoncount,dimercount,nmercount,ntdensity,codonbias,cpgisland,oligoprop),搜索一个序列内的特定模式(seqwordcount),或者搜索开放阅读框(seqshoworfs)。此外,您可以创建测试用例随机序列(randseq)。
序列公用事业——决定达成共识序列从一组用对齐的氨基酸,核苷酸序列(seqconsensus,或一个序列配置文件(seqprofile)。格式的序列显示(seqdisp)或图形显示与频率数据序列比对(seqlogo)。
额外的MATLAB®用正则表达式函数有效地处理字符串操作(正则表达式,seq2regexp)在一个序列中寻找特定模式和搜索字符串匹配的库(seqmatch)。
寻找可能的乳沟地点在DNA / RNA序列通过搜索回文(回文)。
